六神丸是常用中成药之一，在我国已有100多年的应用历史。以往主要用于咽喉肿痛、扁桃体炎、痛疽疮疖等症的治疗，近年发现它还能治流感、流行性腮腺炎、慢性肝炎、带状疱疹等病毒性疾病。由于它用途广泛，价格便宜，是不少人家中常备之药。
由于六神丸处方中含有蟾酥、雄黄、麝香、冰片等成分，限制了该药在某些特定人群中不能使用或慎用。
心脏病患者忌用
六神丸的主要成分之一蟾酥，系一种具有强心作用的固醇混合物，其成分水解产物结构类似强心甙，会引起心律紊乱。蟾酥的药理作用与地高辛相似，两者合用对心脏的作用大大增强，可出现洋地黄中毒症状。故接受强心甙治疗的老年患者要禁用或慎用六神丸。
婴儿禁用
六神丸中的蟾酥和雄黄成分，极易导致小儿过量中毒。一旦过量，快则20分钟，慢则0．5~2小时，个别在12小时以上就会发生中毒反应，故需严格控制适应症与剂量。儿童正处于发育时期，心、肝、肾功能尚未发育完全，若长期大剂量服用六神丸，非常容易造成这些器官的功能慢性损害。一些家长不经医生同意，擅自于暑期前给无任何疾病的孩子服用六神丸，想帮孩子预防疮疖或痱子，结果导致中毒。其中毒表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻、心悸、胸闷、四肢发麻，严重者可出现惊厥甚至死亡。尤其是婴幼儿中毒现象特别常见。因此，该药小儿要慎用、新生儿要禁用。切不可小看小如芝麻的六神丸，过量使用，毒如猛虎。
小儿如必须使用，应严格掌握用药剂量：1岁每次含服1粒，2~3岁每次含服2~3粒，4~8岁每次含服5~6粒，9~15岁每次含服6~8粒。每日2次。若需外用，可取10粒六神丸用温开水适量、米醋少许调成糊状，每日敷搽数次。服药期间，忌食生冷油腻之品；疮疖创面化脓溃烂时不可外敷。切记新生儿要禁用。
孕妇及哺乳期妇女慎用
因六神丸含麝香等成分，会引起胎动和子宫收缩；六神丸中的雄黄成分是砷化合物，含有毒性，对胎儿不利，故孕妇禁用。该药有毒成分可以通过乳汁进入婴儿体内，故哺乳期妇女也应慎用。
过敏者禁用
六神丸还会引起过敏反应。24小时内表现为：瘙痒难忍，喉头水肿，吞咽困难；严重者会出现过敏性休克、胸闷、心悸、呼吸急促、面色苍白、头晕昏睡、四肢湿冷等，需立即抢救。这与用量无关，而且不论内服、外用均会发生。一旦发生类似反应要及时送医院急救，不可大意，且以后不可再用该药。
寒症禁用
六神丸中所含的冰片、珍珠、牛黄等成分，药性寒凉，按照中医“热病寒之”的治疗原则，它仅适用于实热型咽喉疼痛等病人。如果无实热征象者服用了六神丸，则会掩盖或延误病情。譬如病人患风寒型的外感喉痹时，咽喉疼痛，寒热无汗，鼻塞流涕，应选用辛温解表之药，此时若误用六神丸，风寒被闭郁体内，反会导致其他病症。
另外，六神丸不宜与助消化药多酶片及胃蛋白酶合用，也不宜与抗贫血药富马铁片同服，更不宜与解痉止痛药阿托品等联用，否则会增加毒性反应。
